20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0473 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  100 
 
 
189 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0637  haloacid dehalogenase superfamily protein  50.28 
 
 
200 aa  187  8e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.611822  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  48.37 
 
 
192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  47.73 
 
 
204 aa  180  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  45.6 
 
 
190 aa  180  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.74 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  31.18 
 
 
223 aa  63.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  26.97 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  29.51 
 
 
208 aa  58.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  29.93 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.59 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.85 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.33 
 
 
228 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  25.77 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  22.86 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  23.12 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  27.84 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.84 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.84 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  23.86 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>