24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_689 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_689  translin  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  99.52 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  95.85 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  50.79 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  42.03 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  43 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  42.03 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  48.42 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  48.4 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  40.31 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  38.17 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  32.99 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  29.95 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.44 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  30.89 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  28.65 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0790  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.64 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.02 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.23 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0034  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.63 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.84 
 
 		 189 aa  48.9  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.23 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.49 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  24.16 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>