25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1205 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  42.03 
 
 
217 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  46.7 
 
 
223 aa  169  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  41.55 
 
 
210 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  41.06 
 
 
216 aa  165  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  41.06 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  45.9 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  35.58 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  36.71 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  36.71 
 
 
208 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  35.2 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  37.44 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  36 
 
 
205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  35.75 
 
 
196 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0790  haloacid dehalogenase superfamily protein  40.54 
 
 
196 aa  99  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  38.92 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  32.63 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0034  haloacid dehalogenase superfamily protein  38.12 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  31.32 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  29.47 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0637  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.93 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.611822  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.59 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  30.43 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.17 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.95 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>