25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1992 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  56.7 
 
 		 197 aa  240  9e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  33.5 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  32.99 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.39 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  38.95 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  34.57 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  38.32 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.57 
 
 		 231 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  31.75 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  32.11 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  31.05 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  31.69 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0790  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.13 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  29.47 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  32.54 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0034  haloacid dehalogenase superfamily protein  32.34 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  31.74 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  28 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  23.26 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.12 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  22.86 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0637  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.39 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.45 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.33 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>