23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0873 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  80.75 
 
 		 190 aa  315  4e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0637  haloacid dehalogenase superfamily protein  77.89 
 
 		 200 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  77.01 
 
 		 192 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  47.73 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  33.33 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  29.68 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  28.3 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  30.57 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  34.44 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  32.09 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  30.43 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  24.83 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.66 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.45 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.24 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.98 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.45 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  26.49 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.83 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.21 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  29.56 
 
 		 196 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.41 
 
 		 205 aa  42  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>