22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4542 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4542  conjugal transfer protein TraB  100 
 
 		 378 aa  729    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9192  conjugal transfer protein TraB  54.23 
 
 		 403 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7066  conjugal transfer protein TraB  57.89 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9597  conjugal transfer protein TraB  55.29 
 
 		 380 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5512  conjugal transfer protein TraB  56.88 
 
 		 384 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569309  normal  0.0492499 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5391  conjugal transfer protein TraB  54.76 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970188  normal  0.166771 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1610  TraB family protein  35.28 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5410  conjugal transfer protein TraB  32.65 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5005  conjugal transfer protein TraB  32.65 
 
 		 417 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441858  normal  0.356102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1421  conjugal transfer protein TraB  31.28 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2806  TraB family protein  33.06 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0279  conjugal transfer protein TraB  31.73 
 
 		 452 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1731  conjugal transfer protein TraB  30.47 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5093  conjugal transfer protein TraB  30.93 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.685787 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4489  conjugal transfer protein TraB  27.57 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5052  conjugal transfer protein TraB  26.34 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.195661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0069  apolipoprotein N-acyltransferase  27.32 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  22.27 
 
 		 506 aa  51.6  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1272  apolipoprotein N-acyltransferase  27.75 
 
 		 550 aa  46.6  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1577  apolipoprotein N-acyltransferase  24.5 
 
 		 412 aa  46.2  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  27.03 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  27.33 
 
 		 505 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>