16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2806 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2806  TraB family protein  100 
 
 		 405 aa  796    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7066  conjugal transfer protein TraB  34.72 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1610  TraB family protein  34.26 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5512  conjugal transfer protein TraB  36.1 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569309  normal  0.0492499 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5391  conjugal transfer protein TraB  33.67 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970188  normal  0.166771 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4542  conjugal transfer protein TraB  33.23 
 
 		 378 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9597  conjugal transfer protein TraB  30.11 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9192  conjugal transfer protein TraB  29.62 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1421  conjugal transfer protein TraB  32.19 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5005  conjugal transfer protein TraB  28.12 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441858  normal  0.356102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0279  conjugal transfer protein TraB  30.1 
 
 		 452 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5410  conjugal transfer protein TraB  27.32 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1731  conjugal transfer protein TraB  31.16 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4489  conjugal transfer protein TraB  24.34 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5093  conjugal transfer protein TraB  25.56 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.685787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  25.99 
 
 		 487 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0261601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>