18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1610 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1610  TraB family protein  100 
 
 		 397 aa  784    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7066  conjugal transfer protein TraB  37.08 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5512  conjugal transfer protein TraB  37.47 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569309  normal  0.0492499 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9597  conjugal transfer protein TraB  35.38 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4542  conjugal transfer protein TraB  36.55 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9192  conjugal transfer protein TraB  36.26 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5391  conjugal transfer protein TraB  34.98 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970188  normal  0.166771 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2806  TraB family protein  34.26 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5005  conjugal transfer protein TraB  31.23 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441858  normal  0.356102 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5410  conjugal transfer protein TraB  30.97 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1421  conjugal transfer protein TraB  30.45 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0279  conjugal transfer protein TraB  30.23 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1731  conjugal transfer protein TraB  28.64 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5052  conjugal transfer protein TraB  25.98 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.195661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5093  conjugal transfer protein TraB  26.4 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.685787 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4489  conjugal transfer protein TraB  25.12 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  26.02 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0440  apolipoprotein N-acyltransferase  25.8 
 
 		 516 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>