16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1731 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0279  conjugal transfer protein TraB  87.28 
 
 		 452 aa  724    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1421  conjugal transfer protein TraB  93.72 
 
 		 436 aa  775    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1731  conjugal transfer protein TraB  100 
 
 		 446 aa  880    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4542  conjugal transfer protein TraB  30.99 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7066  conjugal transfer protein TraB  28.97 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5391  conjugal transfer protein TraB  31.03 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970188  normal  0.166771 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9192  conjugal transfer protein TraB  30.75 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5512  conjugal transfer protein TraB  30.38 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569309  normal  0.0492499 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9597  conjugal transfer protein TraB  28.24 
 
 		 380 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1610  TraB family protein  28.64 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5005  conjugal transfer protein TraB  28.85 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441858  normal  0.356102 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5410  conjugal transfer protein TraB  26.32 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2806  TraB family protein  30.61 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5093  conjugal transfer protein TraB  23.44 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.685787 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4489  conjugal transfer protein TraB  22.88 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5052  conjugal transfer protein TraB  27.06 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.195661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>