19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9597 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9597  conjugal transfer protein TraB  100 
 
 		 380 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4542  conjugal transfer protein TraB  55.74 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9192  conjugal transfer protein TraB  49.75 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5391  conjugal transfer protein TraB  52.43 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970188  normal  0.166771 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5512  conjugal transfer protein TraB  49.47 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569309  normal  0.0492499 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7066  conjugal transfer protein TraB  52.08 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1610  TraB family protein  36.03 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5410  conjugal transfer protein TraB  32.18 
 
 		 417 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5005  conjugal transfer protein TraB  30.3 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441858  normal  0.356102 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2806  TraB family protein  29.81 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0279  conjugal transfer protein TraB  28.93 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1421  conjugal transfer protein TraB  28.46 
 
 		 436 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1731  conjugal transfer protein TraB  27.2 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5093  conjugal transfer protein TraB  28.71 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.685787 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4489  conjugal transfer protein TraB  26.04 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5052  conjugal transfer protein TraB  24.81 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.195661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0069  apolipoprotein N-acyltransferase  25.24 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.5 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.360623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0540  apolipoprotein N-acyltransferase  27.87 
 
 		 532 aa  42.7  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>