21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5512 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5512  conjugal transfer protein TraB  100 
 
 		 384 aa  747    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569309  normal  0.0492499 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5391  conjugal transfer protein TraB  64.34 
 
 		 387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970188  normal  0.166771 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9192  conjugal transfer protein TraB  58.37 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7066  conjugal transfer protein TraB  58.45 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4542  conjugal transfer protein TraB  57.92 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9597  conjugal transfer protein TraB  49.47 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1610  TraB family protein  37.22 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2806  TraB family protein  33.33 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5410  conjugal transfer protein TraB  28.95 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1421  conjugal transfer protein TraB  29.19 
 
 		 436 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5005  conjugal transfer protein TraB  28.95 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441858  normal  0.356102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0279  conjugal transfer protein TraB  28.09 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1731  conjugal transfer protein TraB  30.38 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4489  conjugal transfer protein TraB  26.67 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5093  conjugal transfer protein TraB  28.18 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.685787 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5052  conjugal transfer protein TraB  25.5 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.195661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1577  apolipoprotein N-acyltransferase  25.13 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  24.84 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  33.72 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0069  apolipoprotein N-acyltransferase  21.55 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  33.72 
 
 		 492 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>