204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4707 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  100 
 
 
428 aa  845    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  52.26 
 
 
416 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  51.31 
 
 
419 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  50.93 
 
 
424 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  50.24 
 
 
417 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  49.18 
 
 
429 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  51.31 
 
 
424 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  39.11 
 
 
418 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  38.07 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  35.08 
 
 
467 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  37.38 
 
 
411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  37.68 
 
 
382 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  34.58 
 
 
472 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  31.64 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4360  glycosyl transferase family 28  32.42 
 
 
443 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000448703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  29.58 
 
 
380 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  26.93 
 
 
374 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  25.58 
 
 
371 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  25.32 
 
 
371 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  26.62 
 
 
387 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  25.58 
 
 
371 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  25.58 
 
 
371 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  25.58 
 
 
371 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  30.26 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
395 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  25.98 
 
 
380 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  29.47 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  28.12 
 
 
383 aa  90.1  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  32.89 
 
 
346 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  28.08 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  30.63 
 
 
389 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  37.74 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  26.8 
 
 
397 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  27.25 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4823  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.44 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  27.13 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  30.39 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1888  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  29.25 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.213265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  26.21 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  27.13 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  26.42 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  39.62 
 
 
424 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
402 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
402 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  23.87 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
409 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  19.14 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
419 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1906  glycosyl transferase family protein  45.59 
 
 
403 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2480  glycosyl transferase family 28  33.33 
 
 
416 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4977  glycosyltransferase, MGT family  27.98 
 
 
378 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1457  glycosyl transferase family 28  32.04 
 
 
415 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  23.1 
 
 
399 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3135  glycosyltransferase, MGT family  36.05 
 
 
428 aa  60.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5611  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
396 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126524  hitchhiker  0.000566285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  24.03 
 
 
397 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1935  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0505353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1037  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  36.96 
 
 
462 aa  60.1  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
427 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3578  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  23.38 
 
 
397 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3248  glycosyltransferase, MGT family  29.76 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3573  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  33.79 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3646  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1905  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  24.3 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0485  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.716398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2896  glycosyltransferase, MGT family  34.62 
 
 
330 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  23.87 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4779  glycosyl transferase family 28  29.61 
 
 
418 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.514672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  21.26 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4150  hypothetical protein  34.06 
 
 
223 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  28.08 
 
 
399 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3273  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
427 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0719433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6794  glycosyl transferase family 28  37.63 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5095  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
427 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509328  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  30.28 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5187  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
429 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00893984  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3732  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
444 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.303192  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0057  glycosyl transferase family 28  32.38 
 
 
427 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  31.01 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4922  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  38.4 
 
 
439 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  38.4 
 
 
439 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2048  glycosyl transferase family 28  33.87 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  38.61 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  37.23 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1849  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  31.61 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0009  glycosyl transferase family 28  36.36 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.463057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2696  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  34.69 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2486  macrolide glycosyltransferase  23.57 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.182202  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3175  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.617571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>