191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1905 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1905  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
410 aa  845    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1906  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
403 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4779  glycosyl transferase family 28  30.4 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.514672 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  27.58 
 
 
416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
419 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6794  glycosyl transferase family 28  26.75 
 
 
412 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  27.38 
 
 
424 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2036  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
452 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  27.91 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
420 aa  140  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  28.37 
 
 
426 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4922  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
475 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  27.05 
 
 
475 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
427 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  26.48 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  26.48 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  27.35 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0558  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0057  glycosyl transferase family 28  22.4 
 
 
427 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3273  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0719433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5095  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509328  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5187  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
429 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00893984  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1457  glycosyl transferase family 28  27.89 
 
 
415 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1350  glycosyl transferase family 28  26.16 
 
 
428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2034  hypothetical protein  25.47 
 
 
412 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.906883  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00487  sterol glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04880)  28.22 
 
 
749 aa  109  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0009  glycosyl transferase family 28  24.83 
 
 
423 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.463057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1800  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 
430 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0485  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
451 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.716398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4524  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 
421 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3043  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.4 
 
 
419 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0177  sterol 3-beta-glucosyltransferase  22.47 
 
 
427 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3732  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
444 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.303192  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2480  glycosyl transferase family 28  24.52 
 
 
416 aa  96.3  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0718  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  23.06 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194717  normal  0.0259108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0690  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  23.06 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0168  sterol 3-beta-glucosyltransferase  22.07 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.398755  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2083  sterol 3-beta-glucosyltransferase  20.96 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5942  glycosyl transferase family 28  23 
 
 
413 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547483  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0362  sterol 3-beta-glucosyltransferase  22.78 
 
 
417 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0442187  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1037  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  23.26 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0907  sterol 3-beta-glucosyltransferase  21.93 
 
 
416 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.499452  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01607  UDP-glucose,sterol transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06750)  22.25 
 
 
1139 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.144836  normal  0.210264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2291  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  25.21 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0972144  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10600  glycosyl transferase, UDP-glucuronosyltransferase  23.11 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4841  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.12 
 
 
443 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8827  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.94 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177267  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3452  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
414 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2048  glycosyl transferase family 28  24.07 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03260  sterol 3-beta-glucosyltransferase, putative  22.35 
 
 
1220 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2852  glycosyl transferase family protein  24.25 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_1174  predicted protein  21.28 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3115  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.448802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3175  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0073  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
419 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3605  sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.87 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4758  glycosyl transferase family 28  22.93 
 
 
418 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4844  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.77 
 
 
434 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2894  sterol 3-beta-glucosyltransferase  25.45 
 
 
435 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3800  sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.45 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.306929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11559  glycosyltransferase  25 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  21.22 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3714  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  24.54 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  23.13 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2387  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5461  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3770  sterol 3-beta-glucosyltransferase  21.38 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93762  predicted protein  26.61 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1915  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  23.1 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_191  Sterol 3-beta-glucosyltransferase (Autophagy-related protein 26) (UDP-glycosyltransferase 51)  21.96 
 
 
1249 aa  70.1  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4642  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3721  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11557  glycosyltransferase  21.86 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0373  sterol 3-beta-glucosyltransferase  23.61 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5006  sterol 3-beta-glucosyltransferase  23.49 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.794532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3101  glycosyl transferase family protein  21.41 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61797  normal  0.564364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32980  glycosyltransferase, MGT family  23.5 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2593  glycosyl transferase family protein  20.05 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5724  Glycosyl transferase  21.96 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0584145  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29850  glycosyltransferase, MGT family  30.86 
 
 
404 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  27.17 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  21.2 
 
 
403 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  21.2 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  21.2 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  24.11 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>