63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4360 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4360  glycosyl transferase family 28  100 
 
 		 443 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000448703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  45.17 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  32.68 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  31 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  30.94 
 
 		 424 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  30.65 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  30.87 
 
 		 419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  32.84 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  29.36 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  29.81 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  32.18 
 
 		 382 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  27.66 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  24.41 
 
 		 467 aa  90.1  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  27.09 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  23.09 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  23.33 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  23.33 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  22.97 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  23.33 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  24.09 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  23.46 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  32.64 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  29.07 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3714  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  30.86 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  30.67 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  27.59 
 
 		 346 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  28.3 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4150  hypothetical protein  34.44 
 
 		 223 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 395 aa  53.5  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  21.95 
 
 		 397 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3877  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123353 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  30.07 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  35.71 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  17.18 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  32.28 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5942  glycosyl transferase family 28  32.73 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  28.91 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2048  glycosyl transferase family 28  38.46 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  30.92 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.23 
 
 		 475 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  34.23 
 
 		 475 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10600  glycosyl transferase, UDP-glucuronosyltransferase  29.36 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  33.96 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>