65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2213 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  757    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  44.95 
 
 
346 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  36.53 
 
 
387 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  34.03 
 
 
380 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  35.73 
 
 
380 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  27.92 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  31.87 
 
 
382 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  27.55 
 
 
429 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  27.92 
 
 
417 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  28.27 
 
 
416 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  28.21 
 
 
419 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  30.21 
 
 
390 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  25.93 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  25.93 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  25.93 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  25.93 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  25.66 
 
 
371 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  27.86 
 
 
424 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  25.92 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  25.75 
 
 
428 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  28.06 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  30.34 
 
 
387 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  25.94 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  28.96 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  24.73 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  25.88 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  22.33 
 
 
403 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  27.05 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  25.12 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4977  glycosyltransferase, MGT family  23.95 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3199  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  24.82 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3911  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.37 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3557  glycosyltransferase MGT family  33.1 
 
 
366 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2896  glycosyltransferase, MGT family  28.38 
 
 
330 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3827  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.15 
 
 
383 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2048  glycosyl transferase family 28  33.81 
 
 
425 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3771  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.04 
 
 
383 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.376405  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6241  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.89 
 
 
443 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0423  glycosyltransferase 28-like protein  21.64 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0073  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  24.69 
 
 
449 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  15.76 
 
 
398 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09090  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  22.79 
 
 
371 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2696  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  28.98 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.63 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  25.12 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3714  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  52.78 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8226  hypothetical protein  27.44 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5611  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126524  hitchhiker  0.000566285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
402 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  27.78 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
402 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3785  macrolide glycosyltransferase-like  24.06 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2248  protein of unknown function DUF1205  27.59 
 
 
370 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1146  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  35.37 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0122052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  19.5 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3069  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.3 
 
 
364 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  22.19 
 
 
396 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0314  glycosyltransferase 28-like protein  34.18 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  25.23 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3868  glycosyltransferase family 28 protein  32.08 
 
 
527 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  0.241184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3732  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
444 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.303192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>