63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2220 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  684    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  44.95 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  37.66 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  35.68 
 
 		 387 aa  212  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  30.31 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  28.47 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  35.71 
 
 		 424 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  26.93 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  33.51 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  26.93 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  26.93 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  26.67 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  26.67 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  39.87 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  29.85 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  31.82 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  32.83 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  32.89 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  27.85 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2896  glycosyltransferase, MGT family  30.22 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  32.98 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  32.8 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  27.9 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  23.48 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  31.28 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  29.28 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4977  glycosyltransferase, MGT family  26.09 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  30.32 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  29.36 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  22.03 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  22.57 
 
 		 467 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3557  glycosyltransferase MGT family  32.65 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1905  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  26.14 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  26.72 
 
 		 456 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3646  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2325  glycosyltransferase, MGT family  20.5 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3573  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3578  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3714  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  25.82 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  24.75 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0423  glycosyltransferase 28-like protein  18.75 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3732  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 444 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.303192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  27.13 
 
 		 429 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  26.64 
 
 		 433 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2048  glycosyl transferase family 28  32.43 
 
 		 425 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1350  glycosyl transferase family 28  34.95 
 
 		 428 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1105  glycosyltransferase, MGT family  22.22 
 
 		 429 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3199  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  24.7 
 
 		 402 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_191  Sterol 3-beta-glucosyltransferase (Autophagy-related protein 26) (UDP-glycosyltransferase 51)  29.75 
 
 		 1249 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  26.11 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1002  glycosyltransferase family 28 protein  24.73 
 
 		 451 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0314  glycosyltransferase 28-like protein  22.12 
 
 		 392 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4659  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.32 
 
 		 443 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.717417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12972  glycosyl transferase  25.28 
 
 		 428 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>