197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4185 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4185  IroB  100 
 
 
382 aa  730    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  38.86 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  37.53 
 
 
424 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  38.22 
 
 
416 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  36.75 
 
 
429 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  37.29 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  37.78 
 
 
417 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  37.23 
 
 
424 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  34.23 
 
 
417 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  33.07 
 
 
378 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  36.5 
 
 
380 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  36.8 
 
 
411 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  33.57 
 
 
418 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  29.34 
 
 
472 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  31.25 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  30.32 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  29.37 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  29.37 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  31.33 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  27.27 
 
 
374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  29.37 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  29.33 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  29.1 
 
 
371 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
395 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  32.47 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  33.76 
 
 
383 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
397 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  31.85 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  29.59 
 
 
390 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  32.67 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  30.1 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
403 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2896  glycosyltransferase, MGT family  31.17 
 
 
330 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3199  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  31.13 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4360  glycosyl transferase family 28  35.29 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000448703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  27.95 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  40.37 
 
 
387 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4977  glycosyltransferase, MGT family  29.61 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  25.63 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2041  putative glycosyl transferase  25.36 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221622  normal  0.0364064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  20.29 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  34.07 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  30.59 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  33.5 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  25.08 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  27.71 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1906  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
403 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  18.36 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6241  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  30.73 
 
 
443 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  34.69 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1700  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
411 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125304  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6239  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.51 
 
 
415 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  normal  0.903811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4150  hypothetical protein  37.78 
 
 
223 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  24.48 
 
 
396 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  31.43 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3877  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123353 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
402 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
402 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1778  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
402 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  38 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3578  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
434 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5358  glycosyl transferase family 28  31.1 
 
 
433 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  25.23 
 
 
456 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  38 
 
 
427 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4823  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  37.5 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  39.82 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.82 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2103  glycosyltransferase family 28 protein  34.73 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646286  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  21.62 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3573  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
434 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3646  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
434 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6794  glycosyl transferase family 28  38.05 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  38.05 
 
 
475 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  38.05 
 
 
475 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3248  glycosyltransferase, MGT family  32.21 
 
 
399 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  28.75 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  36.8 
 
 
426 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  31.93 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
419 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2036  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 
452 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1849  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  33.33 
 
 
412 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2842  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142528  normal  0.0240997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  20.41 
 
 
417 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2325  glycosyltransferase, MGT family  19.37 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  35.2 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  39.77 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  39.77 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>