188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2041 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2041  putative glycosyl transferase  100 
 
 
406 aa  834    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221622  normal  0.0364064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12972  glycosyl transferase  31.97 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12976  glycosyl transferase  32.56 
 
 
449 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1988  putative glycosyl transferase  28.11 
 
 
423 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0156552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0371  UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyltransferase family protein  29.26 
 
 
403 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.105227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1629  glycosyl transferase, UDP-glucuronosyltransferase-like protein  29.34 
 
 
423 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1002  glycosyltransferase family 28 protein  27.42 
 
 
451 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5139  putative glycosyl transferase  25.37 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2592  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
436 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0314  glycosyltransferase 28-like protein  25.43 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2009  glycosyltransferase  24.18 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0518104  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  22.27 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3578  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3573  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3646  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  31.84 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2111  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
425 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000775281  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  29.02 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2103  glycosyltransferase family 28 protein  29.69 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646286  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  28.36 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6241  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  23.78 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1935  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0505353  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0796  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  24.24 
 
 
416 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1888  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  26.73 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.213265  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4043  protein of unknown function DUF1205  30.32 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.392322  normal  0.322652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.13 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  27.86 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6239  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.64 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  normal  0.903811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  27.54 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  28.02 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  26.24 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  29.69 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  30.43 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  33.06 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1806  macrolide glycosyltransferase  23.11 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3843  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.62 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1849  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  26.6 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.67 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3283  glycosyltransferase, MGT family  29.63 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  23.74 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0478  glycosyltransferase family 28 protein  22.64 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.87 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3579  glycosyl transferase family protein  21.96 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00269686  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2407  glycosyltransferase  22.2 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.245126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3139  glycosyl transferase  26.02 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.924253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  23.76 
 
 
426 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0466  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00234533  normal  0.19115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0423  glycosyltransferase 28-like protein  22.9 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22760  glycosyltransferase, MGT family  22.54 
 
 
389 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3265  glycosyltransferase, MGT family  23.18 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1105  glycosyltransferase, MGT family  28.72 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  21.53 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3223  glycosyltransferase, MGT family  28.57 
 
 
446 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3114  Glycosyl transferase-like UDP- glucuronosyltransferase  24.8 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.826951  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5358  glycosyl transferase family 28  25.54 
 
 
433 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  20.76 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5686  glycosyltransferase, MGT family  24.58 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0073  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5223  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0184372  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  22.66 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  27.5 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0168  sterol 3-beta-glucosyltransferase  23.94 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.398755  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0177  sterol 3-beta-glucosyltransferase  25.59 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  22.65 
 
 
403 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4659  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.68 
 
 
443 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.717417  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  21.95 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3199  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.07 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2594  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.64 
 
 
455 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00128778  hitchhiker  0.000911966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3785  macrolide glycosyltransferase-like  26.79 
 
 
265 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  21.13 
 
 
397 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  27.75 
 
 
387 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3135  glycosyltransferase, MGT family  29.93 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  26.23 
 
 
398 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  27.98 
 
 
382 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1781  hypothetical protein  26.59 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2036  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3248  glycosyltransferase, MGT family  27.78 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  21.32 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  24.29 
 
 
412 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2366  glycosyl transferase  24.29 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0820  glycosyltransferase family 28 protein  27.1 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.601054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0976  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  23.36 
 
 
438 aa  57  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103188  hitchhiker  0.00108852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2966  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
408 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5029  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
408 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.153009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3877  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
440 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123353 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2248  protein of unknown function DUF1205  27.35 
 
 
370 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0705  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
423 aa  56.6  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  23.6 
 
 
405 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2382  glycosyl transferase  24.62 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8226  hypothetical protein  26.98 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1296  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.205066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>