149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4716 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  100 
 
 
424 aa  833    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  69.47 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  58.94 
 
 
416 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  59.62 
 
 
419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  58.55 
 
 
424 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  54.81 
 
 
417 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  50.93 
 
 
428 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  37.95 
 
 
417 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  38.73 
 
 
418 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  32.2 
 
 
467 aa  189  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  38.5 
 
 
411 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  37.53 
 
 
382 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  30.93 
 
 
472 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  32.7 
 
 
378 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  30.29 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
395 aa  133  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  31.69 
 
 
380 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4360  glycosyl transferase family 28  30.5 
 
 
443 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000448703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  26.48 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  26.71 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  26.71 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  26.26 
 
 
371 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  26.48 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  28.43 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  28.64 
 
 
380 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  27.92 
 
 
380 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  29.47 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  28.24 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  35.71 
 
 
346 aa  93.6  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  30.45 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  28.27 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3722  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671186  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5611  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126524  hitchhiker  0.000566285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  27.56 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0930  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72237  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1700  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125304  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  27.15 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1778  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  22.38 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3248  glycosyltransferase, MGT family  32.91 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  25.68 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  31.77 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  32.35 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3199  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  29.8 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4408  glycosyltransferase, MGT family  29.35 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2248  protein of unknown function DUF1205  35.57 
 
 
370 aa  67  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  34.71 
 
 
433 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2325  glycosyltransferase, MGT family  22.22 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  36.42 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  31.37 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  24.44 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1888  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  28.16 
 
 
402 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.213265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3557  glycosyltransferase MGT family  36.36 
 
 
366 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32980  glycosyltransferase, MGT family  32.69 
 
 
381 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  28.16 
 
 
402 aa  63.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  31.3 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  21.95 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  28.16 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  24.83 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
398 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2486  macrolide glycosyltransferase  30.77 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.182202  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  36.57 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2408  glycosyltransferase family 28 protein  24.42 
 
 
447 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1935  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
402 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0505353  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  32.26 
 
 
429 aa  60.1  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6239  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.74 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  normal  0.903811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  24.59 
 
 
402 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3283  glycosyltransferase, MGT family  32.91 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  27.18 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  26.1 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
436 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2036  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8226  hypothetical protein  23.91 
 
 
407 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  32.17 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
432 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4659  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  34.55 
 
 
443 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.717417  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3578  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.59 
 
 
449 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3573  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3646  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1566  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
400 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.789406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  35.85 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  23.97 
 
 
402 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2103  glycosyltransferase family 28 protein  37.58 
 
 
427 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646286  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  32.79 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
433 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  34.93 
 
 
426 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0314  glycosyltransferase 28-like protein  18.44 
 
 
392 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4977  glycosyltransferase, MGT family  27.08 
 
 
378 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2021  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
402 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1629  glycosyl transferase, UDP-glucuronosyltransferase-like protein  30.67 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3223  glycosyltransferase, MGT family  25.29 
 
 
446 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>