85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4361 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  100 
 
 
411 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4360  glycosyl transferase family 28  45.55 
 
 
443 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000448703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  40.78 
 
 
417 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  39.02 
 
 
429 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  38.55 
 
 
424 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  39.13 
 
 
416 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  38.72 
 
 
424 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  37.62 
 
 
428 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  38.37 
 
 
419 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  34.46 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  30.64 
 
 
467 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  33.98 
 
 
418 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  37.09 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  29.18 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  31.5 
 
 
380 aa  97.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  26.14 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  26.14 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  26.14 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  26.14 
 
 
371 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  26.14 
 
 
371 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  28.64 
 
 
378 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  29.36 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  23.98 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  30.97 
 
 
389 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  25.76 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  30.71 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  29.22 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  25 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3199  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  30.89 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  27.74 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  26.62 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19110  rhamnosyltransferase chain B  32.57 
 
 
426 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1648  rhamnosyltransferase chain B  32 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93762  predicted protein  42.27 
 
 
434 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  36.84 
 
 
424 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
397 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  22.3 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  37.04 
 
 
416 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  33.85 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1905  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4150  hypothetical protein  33.58 
 
 
223 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0057  glycosyl transferase family 28  33 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  16.67 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  25.42 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  40.16 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  40.16 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11559  glycosyltransferase  27.95 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.37 
 
 
475 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  24.35 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1888  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  23.48 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.213265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.37 
 
 
475 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2896  glycosyltransferase, MGT family  31.53 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6794  glycosyl transferase family 28  47.83 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  23 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
419 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1915  Sterol 3-beta-glucosyltransferase  33.73 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  23 
 
 
402 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1935  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0505353  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4977  glycosyltransferase, MGT family  28.64 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2894  sterol 3-beta-glucosyltransferase  27.05 
 
 
435 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4922  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
435 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  24.35 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0485  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
451 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.716398 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  24.14 
 
 
403 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
402 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
402 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>