56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3739 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3467  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000714931  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3466    99.98 
 
 		 6265 bp  12410    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0369224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3042  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000211872  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2885    99.9 
 
 		 2467 bp  3990    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00487681  hitchhiker  0.00175972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3587  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00101859  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3602    99.87 
 
 		 4752 bp  7844    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.491258  normal  0.0920728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3605  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3700  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3739    100 
 
 		 6415 bp  12720    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.713746  normal  0.0246743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3742  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.165817  normal  0.166782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3473  hypothetical protein  100 
 
 		 228 bp  295  8e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00416358  hitchhiker  0.00128584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0695    84.91 
 
 		 1128 bp  266  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  84.32 
 
 		 2175 bp  250  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  84.32 
 
 		 2175 bp  250  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  84.32 
 
 		 2175 bp  250  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  84.32 
 
 		 2175 bp  250  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4251  IstB domain protein ATP-binding protein  81.67 
 
 		 762 bp  133  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0360  IstB domain protein ATP-binding protein  81.67 
 
 		 762 bp  133  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1309  IstB domain protein ATP-binding protein  81.67 
 
 		 762 bp  133  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1892  IstB domain protein ATP-binding protein  81.67 
 
 		 762 bp  133  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0595448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0011    88.24 
 
 		 770 bp  125  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  84.02 
 
 		 1182 bp  121  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  84.02 
 
 		 1182 bp  121  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  84.02 
 
 		 1182 bp  121  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  84.02 
 
 		 1182 bp  121  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3872  IstB domain protein ATP-binding protein  87.29 
 
 		 792 bp  115  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  0.0551176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  94 
 
 		 2085 bp  75.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  87.01 
 
 		 1596 bp  73.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0694  Tn554-related, transposase C  90.57 
 
 		 444 bp  65.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4778    88.89 
 
 		 2064 bp  60  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175114  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0480  Tn554-related, transposase C  88.68 
 
 		 444 bp  58  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3898  Tn554-related, transposase C  88.68 
 
 		 444 bp  58  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3902  Tn554-related, transposase C  88.68 
 
 		 444 bp  58  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5933  Tn554-related, transposase C  88.68 
 
 		 444 bp  58  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0009  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1572 bp  52  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0359  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1557 bp  52  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.694452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1310  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1557 bp  52  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1893  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1557 bp  52  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4252  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1557 bp  52  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22320  PTS system IIA component/PTS system IIB component/PTS system IIC component  93.94 
 
 		 2127 bp  50.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.215617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2533    80.95 
 
 		 171 bp  50.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000239969  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>