14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4778 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4778    100 
 
 		 2064 bp  4092    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175114  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0360  IstB domain protein ATP-binding protein  83.33 
 
 		 762 bp  99.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1309  IstB domain protein ATP-binding protein  83.33 
 
 		 762 bp  99.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1892  IstB domain protein ATP-binding protein  83.33 
 
 		 762 bp  99.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0595448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4251  IstB domain protein ATP-binding protein  83.33 
 
 		 762 bp  99.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0011    86.67 
 
 		 770 bp  97.6  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3872  IstB domain protein ATP-binding protein  86.87 
 
 		 792 bp  93.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  0.0551176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  91.07 
 
 		 1596 bp  71.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  82.86 
 
 		 2085 bp  65.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2885    88.89 
 
 		 2467 bp  60  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00487681  hitchhiker  0.00175972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3466    88.89 
 
 		 6265 bp  60  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0369224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3739    88.89 
 
 		 6415 bp  60  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.713746  normal  0.0246743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1317  3-hydroxy-acyl-CoA dehydrogenase  96.43 
 
 		 1557 bp  48.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4125  3-hydroxy-acyl-CoA dehydrogenase  96.43 
 
 		 1557 bp  48.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832033  normal  0.309315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>