19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2885 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2885    100 
 
 		 2467 bp  4890    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00487681  hitchhiker  0.00175972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3466    99.95 
 
 		 6265 bp  3701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0369224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3739    99.9 
 
 		 6415 bp  3990    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.713746  normal  0.0246743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3473  hypothetical protein  100 
 
 		 228 bp  295  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00416358  hitchhiker  0.00128584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4251  IstB domain protein ATP-binding protein  78.81 
 
 		 762 bp  188  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1892  IstB domain protein ATP-binding protein  78.81 
 
 		 762 bp  188  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0595448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1309  IstB domain protein ATP-binding protein  78.81 
 
 		 762 bp  188  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0360  IstB domain protein ATP-binding protein  78.81 
 
 		 762 bp  188  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0011    78.18 
 
 		 770 bp  153  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3872  IstB domain protein ATP-binding protein  83.17 
 
 		 792 bp  135  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  0.0551176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  78.73 
 
 		 2085 bp  117  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  87.01 
 
 		 1596 bp  73.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4778    88.89 
 
 		 2064 bp  60  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175114  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0359  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1557 bp  52  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.694452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0009  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1572 bp  52  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1310  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1557 bp  52  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1893  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1557 bp  52  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4252  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1557 bp  52  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22320  PTS system IIA component/PTS system IIB component/PTS system IIC component  93.94 
 
 		 2127 bp  50.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.215617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>