11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2533 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2533    100 
 
 		 171 bp  339  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000239969  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  80.95 
 
 		 2160 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  80.95 
 
 		 2160 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3466    80.95 
 
 		 6265 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0369224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  80.95 
 
 		 2160 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  80.95 
 
 		 2160 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3602    80.95 
 
 		 4752 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.491258  normal  0.0920728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  80.95 
 
 		 2160 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  80.95 
 
 		 2160 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3739    80.95 
 
 		 6415 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.713746  normal  0.0246743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  80.95 
 
 		 2160 bp  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>