62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3602 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3742  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.165817  normal  0.166782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3467  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000714931  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3466    99.87 
 
 		 6265 bp  7844    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0369224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3042  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000211872  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3739    99.87 
 
 		 6415 bp  7844    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.713746  normal  0.0246743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3700  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  100 
 
 		 1182 bp  2343    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3605  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  100 
 
 		 2160 bp  4282    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3602    100 
 
 		 4752 bp  9420    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.491258  normal  0.0920728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3587  hypothetical protein  100 
 
 		 456 bp  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00101859  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0695    84.91 
 
 		 1128 bp  266  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  84.32 
 
 		 2175 bp  250  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  84.32 
 
 		 2175 bp  250  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  84.32 
 
 		 2175 bp  250  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  84.32 
 
 		 2175 bp  250  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  85.77 
 
 		 804 bp  234  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2578    84.08 
 
 		 3716 bp  145  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  84.08 
 
 		 771 bp  145  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  84.02 
 
 		 1182 bp  121  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  84.02 
 
 		 1182 bp  121  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  84.02 
 
 		 1182 bp  121  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  84.02 
 
 		 1182 bp  121  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  79.46 
 
 		 789 bp  79.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  79.46 
 
 		 789 bp  79.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  79.46 
 
 		 789 bp  79.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  79.46 
 
 		 789 bp  79.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  79.46 
 
 		 789 bp  79.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  79.46 
 
 		 789 bp  79.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0694  Tn554-related, transposase C  90.57 
 
 		 444 bp  65.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  86.76 
 
 		 789 bp  63.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  91.67 
 
 		 843 bp  63.9  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5933  Tn554-related, transposase C  88.68 
 
 		 444 bp  58  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3902  Tn554-related, transposase C  88.68 
 
 		 444 bp  58  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3898  Tn554-related, transposase C  88.68 
 
 		 444 bp  58  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0480  Tn554-related, transposase C  88.68 
 
 		 444 bp  58  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  92.5 
 
 		 762 bp  56  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  92.5 
 
 		 834 bp  56  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  92.5 
 
 		 834 bp  56  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  92.11 
 
 		 786 bp  52  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  92.11 
 
 		 786 bp  52  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 705 bp  52  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4172  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 729 bp  52  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2254  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 729 bp  52  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5399  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 729 bp  52  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13669  transposase  84.29 
 
 		 747 bp  52  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0534177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2533    80.95 
 
 		 171 bp  50.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000239969  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6843  IstB ATP binding domain-containing protein  96.55 
 
 		 822 bp  50.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  96.55 
 
 		 768 bp  50.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>