69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2208 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  100 
 
 
104 aa  202  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  55.67 
 
 
98 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  50 
 
 
96 aa  97.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  50.52 
 
 
97 aa  90.5  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  46.94 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  48.98 
 
 
98 aa  87  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  48.45 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  54.44 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  43.88 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1450  hypothetical protein  47.42 
 
 
97 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0274551  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1062  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.0510032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  53.33 
 
 
98 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  53.33 
 
 
98 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  53.33 
 
 
98 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  46.94 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  48 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  47.42 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  47.37 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  43.62 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  41.24 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  44.33 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  43.3 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1444  protein of unknown function DUF503  47.96 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192281  normal  0.342658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  43.88 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1328  hypothetical protein  46.39 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670233  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1371  hypothetical protein  47.42 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  0.118235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7741  protein of unknown function DUF503  46.24 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768404  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  30.95 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  29.33 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  35.21 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  38.03 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  39.47 
 
 
280 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  32.97 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  35.62 
 
 
151 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  36.62 
 
 
151 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  43.75 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1075  hypothetical protein  35.71 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.100296  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  43.75 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  35.8 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  39.39 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  27.47 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3266  protein of unknown function DUF503  36.25 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0150914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  31.88 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  36.62 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  23.91 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  41.82 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  36.62 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2131  protein of unknown function DUF503  27.47 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  31.88 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  36.36 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0985  protein of unknown function DUF503  35 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.531041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  36.99 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  32.35 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  32.39 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  36.76 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  31.67 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  31.67 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  22.22 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>