51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1328 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1328  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  192  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670233  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1450  hypothetical protein  76.29 
 
 
97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0274551  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1371  hypothetical protein  89.69 
 
 
97 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  0.118235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  64.29 
 
 
97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  63.64 
 
 
101 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  59.18 
 
 
97 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  59.79 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1062  hypothetical protein  60.42 
 
 
99 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.0510032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  57.14 
 
 
98 aa  103  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  60.2 
 
 
98 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  60.2 
 
 
99 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  61 
 
 
99 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  54.55 
 
 
99 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  60.2 
 
 
98 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  60.2 
 
 
98 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  60.2 
 
 
98 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  61.22 
 
 
98 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  60.2 
 
 
132 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  59.18 
 
 
99 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  57.14 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  58.16 
 
 
98 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  55.1 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  54.08 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  57.14 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  57.14 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1444  protein of unknown function DUF503  58.16 
 
 
108 aa  85.9  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192281  normal  0.342658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  46.39 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7741  protein of unknown function DUF503  62.64 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768404  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  37.08 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  37.08 
 
 
94 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  34.04 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  37.08 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  32.63 
 
 
94 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  35.56 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  31.03 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  28.72 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  38.1 
 
 
280 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  38.75 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  38.75 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  31.03 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  31.51 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  37.5 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  34.41 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  34.72 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  32.58 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  27.16 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  29.73 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  30.77 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>