48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1450 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1450  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  192  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0274551  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1371  hypothetical protein  77.32 
 
 
97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  0.118235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1328  hypothetical protein  76.29 
 
 
99 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670233  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  58.76 
 
 
96 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  59.18 
 
 
97 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  59.18 
 
 
98 aa  105  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  54.55 
 
 
101 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  60.44 
 
 
98 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  60.44 
 
 
98 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  60.44 
 
 
98 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  57.14 
 
 
98 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  53.06 
 
 
97 aa  100  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  53.06 
 
 
98 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  61.54 
 
 
98 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  58.24 
 
 
97 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  56.12 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  59.34 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  56.99 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  52.04 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1062  hypothetical protein  51.52 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.0510032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  53.06 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  53.06 
 
 
97 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  50.51 
 
 
99 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  58.24 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  53.26 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  47.42 
 
 
104 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1444  protein of unknown function DUF503  56.12 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192281  normal  0.342658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7741  protein of unknown function DUF503  57.61 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768404  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  39.33 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  38.71 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  37.63 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  37.63 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  38.04 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  38.89 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  35.63 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  38.55 
 
 
280 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  36.96 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  32.18 
 
 
93 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  36.99 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  28.57 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  32.35 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  34.78 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  29.03 
 
 
93 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  34.33 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  31.94 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  31.94 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>