74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2117 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  201  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1062  hypothetical protein  79.8 
 
 
99 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.0510032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  72.45 
 
 
101 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  67.35 
 
 
97 aa  140  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  61.62 
 
 
98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  64.29 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  63.64 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  64.29 
 
 
98 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  60.2 
 
 
132 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  61.22 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  60.61 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  59.6 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  60.61 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  60.61 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  57.14 
 
 
97 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  55.1 
 
 
98 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1444  protein of unknown function DUF503  61.22 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192281  normal  0.342658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  58.95 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  57.58 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  56.12 
 
 
96 aa  106  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  56.12 
 
 
99 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  56.12 
 
 
97 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7741  protein of unknown function DUF503  62.77 
 
 
93 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768404  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  53.06 
 
 
97 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1450  hypothetical protein  50.51 
 
 
97 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0274551  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1371  hypothetical protein  56.57 
 
 
97 aa  86.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  0.118235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1328  hypothetical protein  54.55 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670233  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  47.37 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  38.82 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  30.85 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  36.47 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  35.48 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  27.96 
 
 
93 aa  50.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  28.72 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  29.89 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  40.85 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3222  protein of unknown function DUF503  36.36 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.26289 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  32.22 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  32.56 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0708  hypothetical protein  36.84 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  32.18 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1156  protein of unknown function DUF503  26.51 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  34.44 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1075  hypothetical protein  36.67 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.100296  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  27.91 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  27.91 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  44.64 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  31.03 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  31.25 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  39.34 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  34.18 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  25.77 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2131  protein of unknown function DUF503  29.41 
 
 
108 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  30.77 
 
 
151 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  34.94 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  34.94 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  28.72 
 
 
280 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  30.77 
 
 
151 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  30.77 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  39.22 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  30.49 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  31.11 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  31.94 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>