90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2358 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  60.44 
 
 
93 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  54.12 
 
 
93 aa  96.7  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  51.65 
 
 
95 aa  94.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  39.13 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  39.33 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  42.53 
 
 
94 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  40.45 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  39.53 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  40.24 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  46.75 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  41.25 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  37.5 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  45.33 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  36.59 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  38.57 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  43.24 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  32.26 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  37.35 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  43.18 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2131  protein of unknown function DUF503  38.16 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  35.62 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  35.37 
 
 
99 aa  57.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  45.71 
 
 
93 aa  57.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  37.21 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  40.26 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  40.26 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  36.78 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  35.37 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0229  hypothetical protein  35.71 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000241411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  35.63 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1157  hypothetical protein  42.67 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388094  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1075  hypothetical protein  29.07 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.100296  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  32.97 
 
 
95 aa  53.9  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3852  protein of unknown function DUF503  36.11 
 
 
154 aa  53.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.411613  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  34.88 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  34.25 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  32.43 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  36.36 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  39.44 
 
 
93 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  32 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  32.88 
 
 
98 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0708  hypothetical protein  36.62 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  32.43 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  31.43 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  33.87 
 
 
280 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  39.06 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  35.94 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  37.5 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1156  protein of unknown function DUF503  31.43 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1837  protein of unknown function DUF503  27.08 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  37.33 
 
 
93 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  38.24 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  34.25 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  30.14 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  30.14 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  30.14 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  30.14 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  31.51 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1743  protein of unknown function DUF503  32.89 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  38.24 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3266  protein of unknown function DUF503  31.17 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0150914  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  28.74 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_841  hypothetical protein  32.81 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0394209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1690  hypothetical protein  29.17 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.972276  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  28.77 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0985  protein of unknown function DUF503  29.87 
 
 
93 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.531041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  34.94 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1963  hypothetical protein  27.08 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1450  hypothetical protein  31.94 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0274551  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  31.67 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2434  hypothetical protein  27.78 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.211063  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0881  hypothetical protein  28.24 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  30.43 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3726  hypothetical protein  25.58 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.40241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>