59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0708 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0708  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0229  hypothetical protein  40.48 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000241411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  37.8 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  37.8 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0881  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  34.83 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  38.46 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  36.76 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  35.9 
 
 
94 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  36.62 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  36.62 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  38.89 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  38.24 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  34.85 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  34.85 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  42.65 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  36.84 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  36.07 
 
 
93 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  30.43 
 
 
97 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  46.81 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  36.36 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  36.36 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  29.23 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  36.36 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  34.67 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  35.29 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  33.87 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  25.61 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  33.33 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  31.82 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  33.82 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  41.1 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  38.18 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  42  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1062  hypothetical protein  32.89 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.0510032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  31.33 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  36 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  25.61 
 
 
93 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  31.08 
 
 
101 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  30.77 
 
 
95 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  25.93 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  36.36 
 
 
93 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  36.07 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7741  protein of unknown function DUF503  35.62 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768404  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1743  protein of unknown function DUF503  27.5 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  38.89 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>