50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1075 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1075  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  205  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.100296  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  56.47 
 
 
108 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2131  protein of unknown function DUF503  51.52 
 
 
108 aa  107  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  37.66 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  33.77 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  33.77 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  32.47 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  29.07 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  29.07 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  34.02 
 
 
280 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  27.37 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  27.5 
 
 
93 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  30.23 
 
 
93 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  32.14 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  31.52 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  31.25 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  29.87 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  28.75 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  26.32 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1062  hypothetical protein  35.9 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.0510032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  30.77 
 
 
94 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  32.47 
 
 
98 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  32.47 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3726  hypothetical protein  27.16 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.40241  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  30.86 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  30.67 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  24.18 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  35.71 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_841  hypothetical protein  25.26 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0394209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  28.12 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  30.12 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  26.67 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  33.33 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  25.64 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  36.67 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  25.33 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  25.33 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  29.73 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  22.97 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  26.15 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  30.43 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  30.88 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  35.71 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  32.05 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  33.82 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3852  protein of unknown function DUF503  26.32 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.411613  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  27.59 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  24.1 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  19.05 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>