47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_841 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_841  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0394209  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  93.88 
 
 		 98 aa  186  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  80.21 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  34.48 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  35.16 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  30.11 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  34.07 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  34.07 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1743  protein of unknown function DUF503  34.09 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  32.97 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  32.61 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  27.47 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3726  hypothetical protein  27.84 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.40241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  29.21 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  33.78 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  29.35 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  32.94 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  31.08 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  34.12 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  26.09 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  30.77 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  32.91 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  34.52 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  23.66 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  29.47 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  27.38 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1075  hypothetical protein  25.26 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.100296  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  30.99 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  31.18 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  32.81 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  32.81 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2512  protein of unknown function DUF503  31.08 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  20.88 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  24.05 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  30.26 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3266  protein of unknown function DUF503  27.17 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0150914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0985  protein of unknown function DUF503  26.09 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.531041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2434  hypothetical protein  31.08 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.211063  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3852  protein of unknown function DUF503  27.06 
 
 		 154 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.411613  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  26.6 
 
 		 93 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  30 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  30.21 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  34.25 
 
 		 95 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  30 
 
 		 98 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  27.87 
 
 		 92 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>