51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3266 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3266  protein of unknown function DUF503  100 
 
 		 93 aa  185  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0150914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0985  protein of unknown function DUF503  97.85 
 
 		 93 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.531041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  52.17 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  46.24 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  43.01 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  42.39 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1157  hypothetical protein  43.48 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  43.62 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  43.62 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  28.72 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  34.88 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  28.89 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  29.35 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  32.26 
 
 		 93 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  34.72 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  36.05 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  33.75 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  30.59 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  32.56 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  34.44 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  36.96 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  32.63 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  34.88 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  31.52 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  29.35 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  31.17 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  31.17 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  27.17 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  27.17 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  27.91 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  36.25 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  32.56 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  40.82 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_841  hypothetical protein  27.17 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0394209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  31.25 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  34.48 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  32.98 
 
 		 109 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  29.07 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  30.23 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  30.23 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  30.23 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  36.54 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  32.53 
 
 		 93 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  32.53 
 
 		 93 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  32.53 
 
 		 93 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  32.53 
 
 		 93 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  32.53 
 
 		 93 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  30.93 
 
 		 93 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  32.53 
 
 		 93 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>