62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1452 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  58.7 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1157  hypothetical protein  58.06 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3266  protein of unknown function DUF503  52.17 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0150914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0985  protein of unknown function DUF503  51.09 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.531041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  50 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  44.57 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  41.3 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  38.1 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  35.87 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  47.3 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  40.7 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  36.17 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  38.55 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  35.48 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  30.85 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  35.14 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  45.59 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  35.9 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1450  hypothetical protein  38.89 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0274551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  35.44 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  37.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  37.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  39.44 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1371  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.761755  normal  0.118235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  31.76 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2131  protein of unknown function DUF503  33.78 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  36.78 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  43.75 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2512  protein of unknown function DUF503  39.08 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  32.58 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  37.29 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  41.1 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  42.59 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  33.71 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  48.89 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1328  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670233  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  36.99 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  43.4 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  34.29 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1156  protein of unknown function DUF503  28.17 
 
 		 92 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  42.47 
 
 		 99 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2434  hypothetical protein  36.78 
 
 		 96 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.211063  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  40 
 
 		 280 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_841  hypothetical protein  26.6 
 
 		 98 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0394209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  38.18 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  44.83 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  42.62 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  35.71 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0708  hypothetical protein  38.89 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>