59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1915 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2131  protein of unknown function DUF503  74.53 
 
 
108 aa  174  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1075  hypothetical protein  56.47 
 
 
103 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.100296  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  32.93 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  34.62 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  34.62 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  32 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  31.63 
 
 
151 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  39.66 
 
 
94 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  34.18 
 
 
93 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  31.63 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  31.63 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  35.11 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  40.32 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  35.14 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  37.04 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  37.93 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  32.53 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  37.04 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  37.68 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  27.91 
 
 
93 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  37.68 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  37.68 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  24.71 
 
 
93 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  36.23 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  29.67 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  34.78 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  39.13 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  40.68 
 
 
100 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3852  protein of unknown function DUF503  35.53 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.411613  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  32.05 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  34.29 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  36.36 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  30.86 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  30.59 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  26.44 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  25.33 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  26.37 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  25.33 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  28.4 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  38.24 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  39.71 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  27.47 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  33.82 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  30.12 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  30 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  39.34 
 
 
93 aa  42  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  36.92 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  33.82 
 
 
97 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  27.78 
 
 
93 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  31.88 
 
 
97 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  33.82 
 
 
98 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0708  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1450  hypothetical protein  34.33 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0274551  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  30.49 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  35.16 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  29.49 
 
 
92 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>