40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0985 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0985  protein of unknown function DUF503  100 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.531041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3266  protein of unknown function DUF503  97.85 
 
 		 93 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0150914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  51.09 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  45.16 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  41.94 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  41.3 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1157  hypothetical protein  42.39 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  42.55 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  42.55 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  37.68 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  27.66 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  33.72 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  27.78 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  31.18 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  33.33 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  28.26 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  34.88 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  31.4 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  29.41 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  32.5 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  35.87 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  31.58 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  30.43 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  26.74 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  26.09 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  26.09 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  28.26 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  33.33 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2208  protein of unknown function DUF503  35 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000107247  decreased coverage  0.00036449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  37.25 
 
 		 104 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  31.4 
 
 		 99 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  29.87 
 
 		 96 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  29.87 
 
 		 96 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  31.91 
 
 		 109 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_841  hypothetical protein  26.09 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0394209  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  29.79 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  30 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  27.91 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>