71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1705 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  190  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  77.42 
 
 
93 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1157  hypothetical protein  56.52 
 
 
93 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  52.17 
 
 
93 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  47.83 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0985  protein of unknown function DUF503  41.94 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.531041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3266  protein of unknown function DUF503  43.01 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0150914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  52 
 
 
94 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  50.67 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  40.96 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  43.18 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  43.18 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  42.47 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  37.35 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  39.33 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  36.96 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  35.63 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  38.64 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  40 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  40.22 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  38.36 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  43.02 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  34.38 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  48.15 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  52.63 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  37.66 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  40.28 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  37.66 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  38.46 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2512  protein of unknown function DUF503  42.35 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2434  hypothetical protein  38.1 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.211063  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  39.47 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  42.37 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  37.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  33.33 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  37.14 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3726  hypothetical protein  33.77 
 
 
97 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.40241  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  30.67 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  36.05 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0058  protein of unknown function DUF503  33.33 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0708  hypothetical protein  33.87 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  38.03 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  31.46 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0229  hypothetical protein  36.92 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000241411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  30 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  41.27 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1156  protein of unknown function DUF503  27.4 
 
 
92 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  30 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  31.94 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  34.83 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  35.06 
 
 
100 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  34.52 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  47.83 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  31.76 
 
 
280 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  30.34 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1837  protein of unknown function DUF503  25.93 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  31.46 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  31.46 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  31.46 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>