64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0229 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0229  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  179  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000241411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  46.24 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  46.24 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0708  hypothetical protein  40.48 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0881  hypothetical protein  43.04 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  35.71 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  35.71 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  39.08 
 
 
93 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  34.09 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  37.18 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  31.87 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  31.11 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  27.5 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  34.38 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  34.62 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  29.76 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1156  protein of unknown function DUF503  31.82 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  38.33 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  27.27 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  34.52 
 
 
93 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  32.5 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  32.05 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  30.77 
 
 
93 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1837  protein of unknown function DUF503  30.95 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  32.81 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  36.51 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  34.85 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  34.85 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  33.75 
 
 
90 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  26.19 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  29.49 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  32.84 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  26.19 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  24.27 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  32.14 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  38.33 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  29.76 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  27.38 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3461  hypothetical protein  31.25 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  35.06 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  36.92 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  31.25 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  29.69 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  30.68 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  29.69 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  29.69 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  35 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  27.5 
 
 
94 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  28.72 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  33.87 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  28.57 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  33.93 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  38.33 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  30 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  31.25 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  26.92 
 
 
280 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>