More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0877 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0877  CTP synthetase  100 
 
 
548 aa  1136    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.102889  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0171  CTP synthetase  52.47 
 
 
532 aa  588  1e-166  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4476  CTP synthetase  53.22 
 
 
543 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0114  CTP synthetase  52.2 
 
 
538 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.462919  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0468  CTP synthetase  51.92 
 
 
529 aa  578  1e-164  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1833  CTP synthetase  52.67 
 
 
543 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392945  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1738  CTP synthetase  52.21 
 
 
545 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1408  CTP synthetase  52.5 
 
 
542 aa  578  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0617949  hitchhiker  0.0000124662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5202  CTP synthetase  54.16 
 
 
542 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.893159  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2473  CTP synthetase  52.67 
 
 
543 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5402  CTP synthetase  53.04 
 
 
542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4661  CTP synthetase  53.97 
 
 
557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5124  CTP synthetase  53.97 
 
 
542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2824  CTP synthetase  52.49 
 
 
543 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831934  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2790  CTP synthetase  52.12 
 
 
543 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.015258  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3231  CTP synthetase  52.49 
 
 
543 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1634  CTP synthetase  51.39 
 
 
545 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.883771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  49.82 
 
 
545 aa  569  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2233  CTP synthetase  52.31 
 
 
555 aa  568  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5568  CTP synthetase  52.85 
 
 
542 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1134  CTP synthetase  51.76 
 
 
542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519093  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  50.55 
 
 
545 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  52.13 
 
 
542 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3107  CTP synthetase  52.94 
 
 
542 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  51.3 
 
 
545 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0510  CTP synthetase  52.68 
 
 
542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.741524 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1094  CTP synthetase  51.94 
 
 
542 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4200  CTP synthetase  52.87 
 
 
542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.525149 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  51.75 
 
 
533 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  50.37 
 
 
546 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  51.66 
 
 
545 aa  558  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  51.66 
 
 
545 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  51.66 
 
 
545 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  51 
 
 
542 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2029  CTP synthetase  51.39 
 
 
542 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0817  CTP synthetase  51.11 
 
 
545 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.351659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1069  CTP synthetase  51.02 
 
 
542 aa  558  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  0.721377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002506  CTP synthase  50.37 
 
 
546 aa  557  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000244608  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  51.76 
 
 
542 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1832  CTP synthetase  51.39 
 
 
542 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420502  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3387  CTP synthetase  50.93 
 
 
545 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0942417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3546  CTP synthetase  51.11 
 
 
545 aa  557  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4108  CTP synthetase  50 
 
 
542 aa  551  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2744  CTP synthetase  51.84 
 
 
547 aa  551  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0124584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0851  CTP synthetase  51.29 
 
 
545 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  49.45 
 
 
555 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3181  CTP synthetase  51.47 
 
 
547 aa  553  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482242  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  49.26 
 
 
555 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1452  CTP synthetase  51.94 
 
 
542 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  50.74 
 
 
545 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  50.28 
 
 
545 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  49.82 
 
 
542 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  50.18 
 
 
534 aa  550  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  49.82 
 
 
542 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  50.55 
 
 
545 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  49.82 
 
 
542 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  50.55 
 
 
545 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  50.55 
 
 
545 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2012  CTP synthetase  51.56 
 
 
547 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00909929  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2515  CTP synthetase  49.81 
 
 
546 aa  551  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  50.55 
 
 
545 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  51.48 
 
 
531 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  50.09 
 
 
547 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  49.73 
 
 
535 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  49.73 
 
 
535 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0368  CTP synthetase  51.56 
 
 
547 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  50.92 
 
 
531 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  48.71 
 
 
542 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  50.09 
 
 
548 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  49.73 
 
 
535 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  49.26 
 
 
542 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  49.54 
 
 
535 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1973  CTP synthetase  51.1 
 
 
547 aa  548  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.112708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  49.73 
 
 
535 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  48.52 
 
 
540 aa  548  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  51.56 
 
 
557 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  50.73 
 
 
541 aa  545  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  50.37 
 
 
545 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000161678  hitchhiker  0.00000000200253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  49.73 
 
 
535 aa  545  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  49.73 
 
 
535 aa  545  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  49.54 
 
 
535 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  48.7 
 
 
555 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  49.73 
 
 
535 aa  545  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  50.55 
 
 
546 aa  545  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  51.2 
 
 
544 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2017  CTP synthetase  51.11 
 
 
543 aa  542  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  49.45 
 
 
553 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  50.37 
 
 
545 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000222232  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  50.37 
 
 
545 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000110473  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  50 
 
 
543 aa  544  1e-153  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  50.37 
 
 
545 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000112535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  50.64 
 
 
547 aa  542  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  48.52 
 
 
543 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3441  CTP synthetase  50.19 
 
 
546 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  49.36 
 
 
535 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0530  CTP synthetase  51.58 
 
 
542 aa  538  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  49.91 
 
 
546 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1887  CTP synthetase  51.48 
 
 
542 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  50.64 
 
 
534 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1115  CTP synthetase  50.37 
 
 
546 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000891455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>