More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0333 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0333  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 507 aa  1048    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.663896  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 457 aa  392  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 481 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 493 aa  341  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 487 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  38.51 
 
 		 485 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 463 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 488 aa  330  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 480 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 468 aa  330  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 459 aa  329  9e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 465 aa  327  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 479 aa  324  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 460 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 588 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 460 aa  320  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 472 aa  320  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 456 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 466 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 485 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 489 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 485 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 459 aa  317  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 467 aa  316  5e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 470 aa  316  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 456 aa  316  6e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 477 aa  316  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 465 aa  316  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 465 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 486 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 465 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 466 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 459 aa  313  5.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 449 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 468 aa  312  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 486 aa  312  9e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 474 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 460 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 487 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  36.93 
 
 		 497 aa  309  6.999999999999999e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>