More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2652 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2652  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
322 aa  629  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.472929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2657  phosphate ABC transporter inner membrane protein  63.84 
 
 
322 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807772  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  63.84 
 
 
322 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2165  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  63.84 
 
 
322 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.994929  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  46.67 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.06 
 
 
315 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.51 
 
 
322 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.51 
 
 
322 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2332  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  44.48 
 
 
316 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1397  phosphate ABC transporter permease  47.02 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  0.553355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2805  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.08 
 
 
319 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15191  putative phosphate ABC transporter  45.76 
 
 
307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.14 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0311  phosphate ABC transporter permease  42.57 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.884328  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1091  phosphate ABC transporter permease  43.61 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09841  putative phosphate ABC transporter  42.3 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.398578  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2810  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.37 
 
 
327 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.107493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4515  phosphate ABC transporter permease  43 
 
 
342 aa  232  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08651  putative phosphate ABC transporter  42.51 
 
 
326 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.697879  hitchhiker  0.00114126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.75 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.54 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.54 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0727  phosphate ABC transporter permease  40.48 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.127565  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  40.48 
 
 
315 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08661  putative phosphate ABC transporter  43.23 
 
 
315 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.68 
 
 
336 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07751  putative phosphate ABC transporter  40.14 
 
 
315 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.1 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.35 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5253  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.13 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  40.99 
 
 
315 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.72 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  38.96 
 
 
343 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4714  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.19 
 
 
324 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.19 
 
 
324 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.886508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7427  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.45 
 
 
324 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.21 
 
 
328 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2702  phosphate ABC transporter permease  40.88 
 
 
319 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  35.38 
 
 
324 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1273  phosphate transport system permease protein  39.32 
 
 
340 aa  189  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  39.47 
 
 
324 aa  188  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.47 
 
 
324 aa  188  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  39.86 
 
 
326 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2269  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.51 
 
 
316 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  39.12 
 
 
328 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.05 
 
 
337 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  39.12 
 
 
328 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  39.12 
 
 
328 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2371  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.05 
 
 
337 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  40.88 
 
 
316 aa  186  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3105  phosphate ABC transporter permease  40.67 
 
 
331 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44222  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37 
 
 
329 aa  185  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0592  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.44 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.82 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.76 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.76 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.54 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  40.51 
 
 
316 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.14 
 
 
325 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328047  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6689  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.44 
 
 
324 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2343  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.66 
 
 
325 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  0.815793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3268  phosphate ABC transporter, permease protein  40.3 
 
 
331 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2253  phosphate ABC transporter permease  43.02 
 
 
343 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279432  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2205  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.02 
 
 
321 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0353  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.66 
 
 
383 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5388  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.58 
 
 
335 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.16 
 
 
325 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  37.94 
 
 
328 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  37.58 
 
 
328 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  38.51 
 
 
321 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  37.07 
 
 
328 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1178  phosphate transporter permease subunit PstC  38.56 
 
 
328 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  36.88 
 
 
332 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2519  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  41.29 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.947329  normal  0.39229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4151  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.61 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.164424  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  38.54 
 
 
319 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  38.54 
 
 
319 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  38.54 
 
 
319 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  38.54 
 
 
319 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  38.54 
 
 
319 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  34.38 
 
 
324 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1190  phosphate transporter permease subunit PstC  38.24 
 
 
328 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227903  normal  0.373364 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  38.85 
 
 
318 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2025  phosphate transporter permease subunit PstC  39.01 
 
 
324 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619161  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  38.85 
 
 
318 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  38.85 
 
 
318 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  37.17 
 
 
312 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  38.21 
 
 
319 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.21 
 
 
319 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  38.21 
 
 
319 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  38.21 
 
 
319 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  38.21 
 
 
319 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  36.45 
 
 
328 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  36.45 
 
 
328 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  38.21 
 
 
319 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  41.64 
 
 
319 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  38.21 
 
 
319 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  38.21 
 
 
319 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  36.45 
 
 
328 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  36.45 
 
 
328 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>