25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1930 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1930  magnesium-dependent phosphatase-1  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.406995  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1644  magnesium-dependent phosphatase-1  53.09 
 
 
166 aa  193  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193673  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1669  magnesium-dependent phosphatase-1  34.34 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0150  magnesium-dependent phosphatase-1  31.37 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.48 
 
 
300 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0642685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2648  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.48 
 
 
300 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.364708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1218  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.48 
 
 
312 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00165186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  32.22 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  26.35 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  32.94 
 
 
212 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  27.46 
 
 
430 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3229  putative hydrolase  40 
 
 
238 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0208525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.76 
 
 
214 aa  41.6  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  31.87 
 
 
252 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
252 aa  40.8  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
252 aa  40.8  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
252 aa  40.8  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
252 aa  40.8  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
252 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 
226 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  30.77 
 
 
252 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37770  putative hydrolase  33.78 
 
 
222 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00140245  normal  0.135547 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
252 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
252 aa  40.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>