45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0735 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0735  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  683    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.343494  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0032  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  57.75 
 
 
347 aa  386  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0903519  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1534  hypothetical protein  51.52 
 
 
336 aa  285  7e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0192109 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1368  hypothetical protein  49.03 
 
 
329 aa  257  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.158176  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0295  hypothetical protein  48.06 
 
 
329 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0178  hypothetical protein  40 
 
 
349 aa  215  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.635115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0191  hypothetical protein  42.35 
 
 
347 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.912961  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0322  hypothetical protein  37.61 
 
 
353 aa  207  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1339  hypothetical protein  36.95 
 
 
362 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0525  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  38.14 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0614  hypothetical protein  35.84 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1336  hypothetical protein  35.78 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1349  hypothetical protein  35.59 
 
 
350 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.685981  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0703  hypothetical protein  37.54 
 
 
342 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.304347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1589  hypothetical protein  37.2 
 
 
337 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0400  hypothetical protein  41.28 
 
 
351 aa  179  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1548  hypothetical protein  37.65 
 
 
336 aa  179  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0735  hypothetical protein  35.37 
 
 
338 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.975943  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1444  hypothetical protein  37.38 
 
 
336 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0615  hypothetical protein  33.81 
 
 
360 aa  176  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2681  hypothetical protein  34.12 
 
 
370 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1555  hypothetical protein  32.11 
 
 
368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.97831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3419  nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
374 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0342  hypothetical protein  33.14 
 
 
368 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2836  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  38.03 
 
 
349 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2793  hypothetical protein  34.29 
 
 
368 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  0.613247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3324  hypothetical protein  33.82 
 
 
368 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3064  hypothetical protein  32.39 
 
 
385 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0990  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 
388 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2498  hypothetical protein  36.36 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0230  hypothetical protein  36.16 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.194869 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04941  hypothetical protein  33.94 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.011147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04631  hypothetical protein  34.44 
 
 
385 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2245  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  34.76 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2268  hypothetical protein  29.53 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.495268 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0438  hypothetical protein  34.14 
 
 
385 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.448749  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04361  hypothetical protein  30.86 
 
 
400 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04941  hypothetical protein  30.46 
 
 
398 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.374078  normal  0.323287 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0107  hypothetical protein  30.72 
 
 
336 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05011  hypothetical protein  31.23 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.247608  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1771  hypothetical protein  29.68 
 
 
398 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06331  hypothetical protein  31.73 
 
 
425 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0600  hypothetical protein  31.12 
 
 
399 aa  95.9  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.558347  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1762  hypothetical protein  31.55 
 
 
379 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2158  hypothetical protein  23.38 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.531201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>