18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2158 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2158  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.531201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2793  hypothetical protein  27.13 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  0.613247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3324  hypothetical protein  28.19 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0342  hypothetical protein  26.82 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2681  hypothetical protein  25.21 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0438  hypothetical protein  24.64 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.448749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3064  hypothetical protein  22.87 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3419  nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  24.86 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1534  hypothetical protein  22.35 
 
 		 336 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0192109 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0032  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  22.42 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0903519  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04631  hypothetical protein  23.55 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1555  hypothetical protein  23.55 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.97831 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0230  hypothetical protein  24.65 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.194869 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1349  hypothetical protein  24.04 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.685981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0614  hypothetical protein  23.8 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05011  hypothetical protein  26.75 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.247608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0703  hypothetical protein  24.44 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.304347 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04941  hypothetical protein  23.81 
 
 		 385 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.011147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>