45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0230 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0230  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  660    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.194869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2836  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  57.31 
 
 
349 aa  311  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2245  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  58.67 
 
 
336 aa  310  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2498  hypothetical protein  53.47 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0990  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
388 aa  302  7.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0178  hypothetical protein  38.11 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.635115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0703  hypothetical protein  38.68 
 
 
342 aa  190  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.304347 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0735  hypothetical protein  42.59 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.975943  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0191  hypothetical protein  38.55 
 
 
347 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.912961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0400  hypothetical protein  37.64 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0525  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  39.02 
 
 
336 aa  169  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1548  hypothetical protein  37.83 
 
 
336 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1444  hypothetical protein  35.19 
 
 
336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1534  hypothetical protein  39.2 
 
 
336 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0192109 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1589  hypothetical protein  37.31 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0295  hypothetical protein  42.26 
 
 
329 aa  155  9e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1368  hypothetical protein  40.59 
 
 
329 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.158176  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1349  hypothetical protein  32.74 
 
 
350 aa  152  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.685981  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0032  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
347 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0903519  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0615  hypothetical protein  30.65 
 
 
360 aa  150  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1336  hypothetical protein  31.32 
 
 
350 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9826  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0614  hypothetical protein  31.03 
 
 
362 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0735  hypothetical protein  36.52 
 
 
343 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.343494  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1339  hypothetical protein  31.4 
 
 
362 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0342  hypothetical protein  34.18 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0322  hypothetical protein  31.27 
 
 
353 aa  135  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1555  hypothetical protein  34.74 
 
 
368 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.97831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3324  hypothetical protein  32.01 
 
 
368 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2793  hypothetical protein  31.73 
 
 
368 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  0.613247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3064  hypothetical protein  33.05 
 
 
385 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3419  nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  32.94 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2681  hypothetical protein  32.74 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2268  hypothetical protein  34.36 
 
 
381 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.495268 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0107  hypothetical protein  31.02 
 
 
336 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04631  hypothetical protein  29 
 
 
385 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04361  hypothetical protein  29.79 
 
 
400 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04941  hypothetical protein  28.1 
 
 
385 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.011147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0438  hypothetical protein  28.65 
 
 
385 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.448749  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06331  hypothetical protein  33.43 
 
 
425 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0600  hypothetical protein  32.34 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.558347  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05011  hypothetical protein  27.33 
 
 
385 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.247608  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04941  hypothetical protein  25.9 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.374078  normal  0.323287 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1771  hypothetical protein  25.96 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1762  hypothetical protein  33.14 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2158  hypothetical protein  25.63 
 
 
358 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.531201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>