44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0600 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0600  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  776    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.558347  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04361  hypothetical protein  51.97 
 
 
400 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1762  hypothetical protein  65.66 
 
 
379 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04941  hypothetical protein  47.7 
 
 
398 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.374078  normal  0.323287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06331  hypothetical protein  54.27 
 
 
425 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1771  hypothetical protein  47.06 
 
 
398 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04941  hypothetical protein  41.48 
 
 
385 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.011147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0438  hypothetical protein  40.28 
 
 
385 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.448749  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04631  hypothetical protein  41.19 
 
 
385 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05011  hypothetical protein  39.71 
 
 
385 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.247608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2681  hypothetical protein  36.34 
 
 
370 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2793  hypothetical protein  36.9 
 
 
368 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  0.613247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3324  hypothetical protein  36.52 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3419  nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 
374 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0342  hypothetical protein  40.82 
 
 
368 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3064  hypothetical protein  37.1 
 
 
385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1555  hypothetical protein  38.76 
 
 
368 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.97831 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0615  hypothetical protein  27.32 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0032  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0903519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2268  hypothetical protein  38.42 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.495268 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1349  hypothetical protein  30.09 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.685981  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0322  hypothetical protein  31.62 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1336  hypothetical protein  28.94 
 
 
350 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9826  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1339  hypothetical protein  29.23 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0614  hypothetical protein  29.11 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0178  hypothetical protein  30.73 
 
 
349 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.635115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1534  hypothetical protein  32.27 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0192109 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1589  hypothetical protein  31.07 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2836  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 
349 aa  106  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1368  hypothetical protein  32.64 
 
 
329 aa  99.8  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.158176  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0191  hypothetical protein  30.64 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.912961  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0295  hypothetical protein  32.64 
 
 
329 aa  97.1  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1444  hypothetical protein  29.82 
 
 
336 aa  96.7  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0735  hypothetical protein  31.12 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.343494  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2498  hypothetical protein  30.11 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0735  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.975943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0525  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  31.28 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2245  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  31.72 
 
 
336 aa  87  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0107  hypothetical protein  28.93 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0703  hypothetical protein  29.43 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.304347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1548  hypothetical protein  31.44 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0230  hypothetical protein  31.67 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.194869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0990  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0400  hypothetical protein  28.04 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>