44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1771 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1771  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  806    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04941  hypothetical protein  97.74 
 
 
398 aa  775    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.374078  normal  0.323287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04361  hypothetical protein  52.88 
 
 
400 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06331  hypothetical protein  52.24 
 
 
425 aa  358  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0600  hypothetical protein  46.94 
 
 
399 aa  335  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.558347  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05011  hypothetical protein  42.63 
 
 
385 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.247608  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04941  hypothetical protein  43.34 
 
 
385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.011147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0438  hypothetical protein  42.3 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.448749  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04631  hypothetical protein  43.41 
 
 
385 aa  301  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1762  hypothetical protein  49.86 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3064  hypothetical protein  38.02 
 
 
385 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0342  hypothetical protein  39.94 
 
 
368 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3324  hypothetical protein  36.54 
 
 
368 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2793  hypothetical protein  36.26 
 
 
368 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  0.613247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2681  hypothetical protein  37.61 
 
 
370 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3419  nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 
374 aa  191  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1555  hypothetical protein  35.28 
 
 
368 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.97831 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2268  hypothetical protein  40.18 
 
 
381 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.495268 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0615  hypothetical protein  30.16 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0032  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0903519  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1336  hypothetical protein  30.88 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9826  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1339  hypothetical protein  31.63 
 
 
362 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0178  hypothetical protein  31.88 
 
 
349 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.635115 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1349  hypothetical protein  29.33 
 
 
350 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.685981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0614  hypothetical protein  30.21 
 
 
362 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1534  hypothetical protein  29.61 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0192109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0191  hypothetical protein  29.81 
 
 
347 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.912961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1368  hypothetical protein  31.14 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.158176  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0322  hypothetical protein  31.01 
 
 
353 aa  110  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0735  hypothetical protein  31.82 
 
 
343 aa  110  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.343494  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1444  hypothetical protein  29.45 
 
 
336 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2836  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
349 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0295  hypothetical protein  30.03 
 
 
329 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0703  hypothetical protein  29.18 
 
 
342 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.304347 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0735  hypothetical protein  29.72 
 
 
338 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.975943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1589  hypothetical protein  29.14 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0525  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  28.57 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0400  hypothetical protein  30.95 
 
 
351 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2498  hypothetical protein  28.7 
 
 
333 aa  90.1  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0990  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
388 aa  89.7  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2245  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  27.84 
 
 
336 aa  87  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1548  hypothetical protein  29.07 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0230  hypothetical protein  25.75 
 
 
356 aa  77  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.194869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0107  hypothetical protein  26.38 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>