44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1548 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1548  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  671    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0735  hypothetical protein  61.56 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.975943  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0703  hypothetical protein  58.93 
 
 
342 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.304347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1589  hypothetical protein  60 
 
 
337 aa  382  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1444  hypothetical protein  53.43 
 
 
336 aa  346  3e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0178  hypothetical protein  39.76 
 
 
349 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.635115 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0400  hypothetical protein  40.79 
 
 
351 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2498  hypothetical protein  40.37 
 
 
333 aa  199  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0191  hypothetical protein  40.49 
 
 
347 aa  189  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.912961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0990  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 
388 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2245  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  38.87 
 
 
336 aa  182  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2836  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0525  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  40.31 
 
 
336 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0615  hypothetical protein  38.93 
 
 
360 aa  176  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0032  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
347 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0903519  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0322  hypothetical protein  34.7 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1349  hypothetical protein  35.37 
 
 
350 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.685981  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0735  hypothetical protein  37.65 
 
 
343 aa  159  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.343494  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0614  hypothetical protein  36 
 
 
362 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1336  hypothetical protein  36.31 
 
 
350 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9826  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0230  hypothetical protein  37.54 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.194869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1339  hypothetical protein  35.87 
 
 
362 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1534  hypothetical protein  37.69 
 
 
336 aa  151  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0192109 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1368  hypothetical protein  37.66 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.158176  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2681  hypothetical protein  35.99 
 
 
370 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0295  hypothetical protein  37.93 
 
 
329 aa  132  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3064  hypothetical protein  33.97 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0342  hypothetical protein  35.98 
 
 
368 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2793  hypothetical protein  36.15 
 
 
368 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  0.613247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3324  hypothetical protein  35.4 
 
 
368 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1555  hypothetical protein  34.88 
 
 
368 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.97831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3419  nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
374 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0107  hypothetical protein  30.75 
 
 
336 aa  106  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04631  hypothetical protein  31 
 
 
385 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05011  hypothetical protein  28.1 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.247608  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04941  hypothetical protein  29.79 
 
 
385 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.011147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2268  hypothetical protein  35.57 
 
 
381 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.495268 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0438  hypothetical protein  29.09 
 
 
385 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.448749  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06331  hypothetical protein  31.15 
 
 
425 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04941  hypothetical protein  28.78 
 
 
398 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.374078  normal  0.323287 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0600  hypothetical protein  33.19 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.558347  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1771  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04361  hypothetical protein  29.77 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1762  hypothetical protein  28.21 
 
 
379 aa  57  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>