44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1762 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1762  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  733    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0600  hypothetical protein  64.12 
 
 
399 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.558347  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06331  hypothetical protein  59.73 
 
 
425 aa  348  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04361  hypothetical protein  54.18 
 
 
400 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04941  hypothetical protein  49.86 
 
 
398 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.374078  normal  0.323287 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1771  hypothetical protein  49.86 
 
 
398 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04941  hypothetical protein  41.45 
 
 
385 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.011147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0438  hypothetical protein  41.98 
 
 
385 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.448749  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04631  hypothetical protein  41.16 
 
 
385 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05011  hypothetical protein  38.33 
 
 
385 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.247608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2681  hypothetical protein  38.59 
 
 
370 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2793  hypothetical protein  38.22 
 
 
368 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  0.613247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0342  hypothetical protein  41.92 
 
 
368 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3324  hypothetical protein  37.93 
 
 
368 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3064  hypothetical protein  38.46 
 
 
385 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3419  nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 
374 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1555  hypothetical protein  37.07 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.97831 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0032  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
347 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0903519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2268  hypothetical protein  40.22 
 
 
381 aa  135  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.495268 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0615  hypothetical protein  32.53 
 
 
360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1349  hypothetical protein  31.85 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.685981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0178  hypothetical protein  30.59 
 
 
349 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.635115 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1336  hypothetical protein  31.33 
 
 
350 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9826  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0614  hypothetical protein  31.31 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1339  hypothetical protein  31.31 
 
 
362 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2836  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0191  hypothetical protein  31.64 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.912961  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0735  hypothetical protein  31.7 
 
 
343 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.343494  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2498  hypothetical protein  33.05 
 
 
333 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0703  hypothetical protein  30.68 
 
 
342 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.304347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1589  hypothetical protein  31.25 
 
 
337 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0322  hypothetical protein  28.29 
 
 
353 aa  100  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1444  hypothetical protein  30.15 
 
 
336 aa  100  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1368  hypothetical protein  33.04 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.158176  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1534  hypothetical protein  29.86 
 
 
336 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0192109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0735  hypothetical protein  34.62 
 
 
338 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.975943  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0990  Nicotinate-nucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0295  hypothetical protein  31.36 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0230  hypothetical protein  32.71 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.194869 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0525  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  33.92 
 
 
336 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2245  Nicotinate-nucleotide- dimethylbenzimidazolephosp horibosyltransferase  31.75 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1548  hypothetical protein  30.92 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0107  hypothetical protein  26.76 
 
 
336 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0400  hypothetical protein  30.57 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>